Milk-sensor: Nye metoder for bedre avl, helse og reproduksjon hos norske mjølkekyr basert på nær infrarød spektroskopi, sensorinformasjon og registerdata

iKu-prosjektet har som mål å øke bruken av tilgjengelige data om melkekyrs helse og reproduksjon for å etablere forbedrede fenotyper for genetisk seleksjon og nye bioindikatorer for helse og reproduksjon. Månedlige rutinemelkeprøver analysert ved Fourier Transform Infrared (FTIR) spektroskopi vil bli brukt til å forutsi uønskede fruktbarhets- og helseutfall relatert til negativ energibalanse som forsinket utbrudd av brunst etter kalving, subklinisk ketose, klinisk endometritt og laminitt. Også patogen(gruppe)spesifikke tilfeller av mastitt vil bli forutsagt av FTIR-spektraldata og databasen om melkekulturresultater. Til sammen fem nye fenotyper vil bli utsatt for genomisk avlsverdiestimering ved bruk av Genos SNP-brikkegenotyper med høy tetthet.

Forutsigbarheten til nye fenotyper og bioindikatorer vil bli forbedret ved hjelp av informasjon fra automatiske melkesystemer (melkerobot), sensorer som online celletellere (OCC), aktivitetsmålinger, kroppsvektskalaer og data fra besetningsregistreringer om behandling, jurpatogener, somatisk celletall, inseminering, utslakting, produksjon og mer. Nye matematiske tilnærminger for høydimensjonale og longitudinelle data vil bli utviklet for påvisning av ugunstige fruktbarhets- og helsehendelser hos enkeltdyret, for avlsformål og for forvaltning av melkebesetningen. Vi vil bruke fettsyreprofiler for å etablere terskler (benchmarks) som hjelper forvaltningsbeslutninger på enkeltdyr- og besetningsnivå. Prosjektet tar også sikte på å etablere gårdsspesifikke maskinlæringsalgoritmer for overvåking av helse og fruktbarhet.

I iKu-prosjektet har et tverrfaglig team av anerkjente norske forskere sluttet seg til å etablere en plattform for innsamling, analyse og utnyttelse av big data for å styrke avl og helsestyring av norske melkekyr. Vi forventer at plattformen utvides etter hvert som forskningen skrider frem, og midler til ytterligere en doktorgradsstudent er allerede bevilget av NMBU.